带证二级生物安全柜可保护工作人员和环境而不保护样品。气流原理和实验室通风橱一样，不同之处在于排气口安装有HEPA过滤器。所有类型的生物安全柜都在排气和进气口使用HEPA过滤器。

 

    从带证二级生物安全柜前脸的开口流入柜内的气流速度约为0.45米/秒。以这一风速，柜内单向流的一致性易受干扰，很容易被安全柜附近人员的走动、开窗、送风配风器、门的开关所干扰。按理想的布置，应放在远离活动及可能有干扰气流的地方。应尽量在安全柜的后侧及两侧留下30厘米的空间，便于维护作业。柜子上方则留下30～35厘米的高度，以便对排风过滤器的风速进行测量，并为排风过滤器的换留下足够空间。